MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methylobacterium nodulans ORS 2060 plasmid pMNOD05

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011888	CGG	2	6	13	18	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011888	ATG	2	6	21	26	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011888	TCA	2	6	74	79	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011888	AGGT	2	8	112	119	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011888	CTGGT	2	10	128	137	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_011888	G	6	6	149	154	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011888	CT	3	6	196	201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011888	GA	3	6	353	358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011888	CAG	2	6	382	387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011888	GTT	2	6	465	470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011888	GACAG	2	10	481	490	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_011888	GCG	2	6	509	514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011888	TTATA	2	10	615	624	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011888	TCG	3	9	5574	5582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011888	A	6	6	5626	5631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011888	GCC	2	6	5679	5684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_011888	ACGG	2	8	5710	5717	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011888	GCC	2	6	5719	5724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_011888	GC	3	6	7316	7321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_011888	CG	3	6	7360	7365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_011888	GTG	2	6	7407	7412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011888	CTGC	2	8	7413	7420	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011888	GCT	2	6	7454	7459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011888	CGCC	3	12	7489	7500	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_011888	GCG	2	6	7652	7657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011888	CGGT	2	8	7667	7674	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_011888	TCC	2	6	7708	7713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_011888	GCG	2	6	7792	7797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011888	CG	3	6	8641	8646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011888	GGAC	2	8	8650	8657	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011888	GCC	2	6	8668	8673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_011888	GCA	2	6	8678	8683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011888	GCCAGC	2	12	8738	8749	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011888	AGCG	2	8	8761	8768	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_011888	AT	3	6	8803	8808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011888	GA	3	6	9888	9893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011888	AGG	2	6	10762	10767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011888	GCG	2	6	10821	10826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011888	AGC	3	9	10889	10897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011888	CG	3	6	11323	11328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011888	GTT	2	6	11382	11387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011888	C	7	7	11542	11548	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
43	NC_011888	CCGT	2	8	11832	11839	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_011888	CAT	2	6	11881	11886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011888	CTC	2	6	11890	11895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_011888	GGC	2	6	11998	12003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011888	GCCG	2	8	12072	12079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_011888	CGG	2	6	12088	12093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011888	ACG	2	6	12100	12105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011888	TTG	2	6	12136	12141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011888	CCG	2	6	12173	12178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_011888	GAA	2	6	12253	12258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011888	ACC	2	6	12305	12310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_011888	GC	3	6	13151	13156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011888	GCC	2	6	13170	13175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_011888	CTGCG	2	10	13219	13228	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_011888	GGAG	2	8	13234	13241	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011888	GAC	2	6	13242	13247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011888	CACG	2	8	13394	13401	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_011888	CA	3	6	13414	13419	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011888	AT	3	6	13463	13468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011888	CAT	2	6	14433	14438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011888	T	6	6	14447	14452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011888	GAA	2	6	14469	14474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011888	CTG	2	6	14628	14633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011888	AGA	2	6	14641	14646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011888	GCC	2	6	14670	14675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_011888	CGCC	2	8	14755	14762	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
69	NC_011888	AGGC	2	8	14783	14790	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_011888	CGAA	2	8	17234	17241	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_011888	AGC	2	6	17278	17283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011888	CT	3	6	17359	17364	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_011888	AG	3	6	17391	17396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011888	GTT	2	6	17407	17412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011888	GGGC	2	8	17452	17459	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_011888	CGA	2	6	17460	17465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011888	AGG	2	6	17488	17493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011888	GGC	2	6	17621	17626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011888	G	6	6	17710	17715	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011888	AGGT	2	8	17740	17747	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011888	ATG	2	6	17782	17787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011888	TCG	2	6	17857	17862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011888	CG	3	6	17906	17911	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_011888	CCT	2	6	17915	17920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_011888	GGA	2	6	17927	17932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011888	GC	3	6	17995	18000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_011888	CTCGGC	2	12	18016	18027	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
88	NC_011888	CG	3	6	18031	18036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_011888	CG	4	8	18074	18081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_011888	CGC	2	6	18098	18103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_011888	GCC	2	6	18202	18207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_011888	GA	3	6	19223	19228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011888	GGC	2	6	19243	19248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011888	CGA	2	6	19767	19772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011888	GCCA	2	8	19785	19792	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_011888	CAA	2	6	19810	19815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011888	GAGC	2	8	19899	19906	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_011888	T	9	9	19977	19985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011888	AGCGC	2	10	20051	20060	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_011888	CGGG	2	8	20072	20079	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_011888	C	6	6	20125	20130	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
102	NC_011888	ATC	2	6	20169	20174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.